{{foreach item=item key=key from=$List}}
{{assign var="flag" value="0"}}
  {{foreach key=key2 item=item2 from=$List_check}}
    {{if $item.id==$item2}}
      <input name="list[]" type="checkbox" value="{{$item.id}}" />{{$item.name}}
      {{assign var="flag" value="1"}}
    {{/if}}
  {{/foreach}}
{{if $flag!=1}}
  <input name="list[]" type="checkbox" value="{{$item.id}}" />{{$item.name}}
{{/if}}
{{/foreach}}